dredknightI agree but that way we cannot cover very strong perks with a chain of weaker/different one and we have to balance the all trees from scratch.

Я понял, т.е. это не желаемая, а необходимая мера для балансировки сильных умений. Альтернативой могло бы стать усиление слабых умений, хотя и не для всех умений это возможно.
Например, в моей модификации умение "снижение магического урона на 15%" относится к категории слабых и его нельзя естественным образом усилить, но следующим умением в этой же ветке выступает умение "+15% к здоровью", которое очень сильное и позволяет этой ветке конкурировать как с Vitality + Power of Stone, так и с 30% Evasion + Stand Your Ground.
Хотя с точки зрения снижения вариативности, все равно получается жертва, но в такой реализации по крайней мере нет понятия "обязательное умение".