Как раз файл index.bin и отвечает за отображение элементов редактора. Тот, что генерируется редактором в карте, "недееспособен" и постоянно сбрасывает из видимости все пути.

В случае с героем — всегда можете выставить любого другого героя и прописать ему в графе Shared точные путь+имя к AdvMapHeroShared своего нового.

Чтобы отображались всегда герои, настройте Расширенный редактор карт (FAQ висит в разделе) и выберите таблицу AdvMapHeroShared. Там создаёте нового героя, предварительно нажав Resource=>Close MOD. Все файлы нового героя окажутся в ПапкаИгры/data/, в том числе полный index.bin с сохранённой информацией о шэйрде героя. Когда работу над картой закончите, скопируйте файлы из data в архив карты.

Важно! Все файлы, лежащие в data, увидят и редактор, и игра, поэтому на промежуточных этапах копировать файлы смысла нет. Только в конце, перед выкладыванием.