Рекомендую начинать с малого, а не с изменения всего и вся! Также советую разобраться с расширенным редактором карт, так будет проще ориентироваться в файловой системе.
1) a2p1-data.pak/GameMechanics/RPGStats/DefaultStats.xdb => combat => HeroSkills => Necromancer - здесь параметры, связанные с тёмной энергией и некромантией
2) Специализации героев зашиты в exe, но какие-то коэффициенты могут быть всё в том же DefaultStats.xdb
3) В свойствах выставленного на карту героя заходите в Shared => ... => В появившемся окне ищете стартовый навык героя и меняете на нужный. Глобальные характеристики всех навыков в GameMechanics/RefTables/Skills.xdb
4) Либо в DefaultStats.xdb, либо в exe. Поскольку менять исполняемый файл крайне трудно, поищите подходящий патч на гитхабе проекта Герои 5.5
5) Игра действительно вылетает, как пофиксить не в курсе
6) ABILITY_VORPAL_SWORD
7) Где-то меняется, где - не помню
8) В DefaultStats можно поставить вероятность получения артефакта из сундука нулевой. В оригинале она равна 4%
9) Там же, где и меняли абилки существ, но найдите свойство Visual и файл, указанный там. А описания абилок существ меняются в GameMechanics/RefTables/CombatAbilities.xdb