Дык клонам вроде не положено думать?

Хотя Палпатин не мог лично отдать приказ каждому командиру, он потратил некоторое время, чтобы связаться с некоторыми из них до того, как Приказ 66 был передан всей армии. В первые минуты после приказа были убиты несколько членов Совета джедаев: Пло Кун на Като Неймодия, погибший от рук капитана Джага, Стасс Аллие на Салукемае, убитый коммандером Нейо и Ки-Ади-Мунди на Миджито, ставший жертвой коммандера Бакары. На Утапау Оби-Ван Кеноби скакал на варактиле по кличке Бога, когда коммандер Коди исполнил приказ и скомандовал AT-TE расстрелять джедая, но Кеноби смог спастись и покинуть планету. Позднее он встретился с гранд-мастером Йодой, который также избежал смерти на Кашиике, отразив нападение коммандера Гри.

Как было отмечено, не все солдаты-клоны подчинились Приказу 66. На Мурхане Роан Шрайн и Оли Старстоун были спасены солдатом Климбером из отряда клонов-коммандо, который сначала запросил подтверждение приказа, а получив его, отказался встать на сторону правительства против тех, с кем воевал, проникнувшись расположение к джедаям. В результате он был жестоко наказан. Однако это единственный известный на данный момент случай, когда солдат нарушил приказ, во всех остальных клоны-командиры и АРК-клоны выполняли его беспрекословно.