Я правильно понял, что если первую крысу лишить НД, то обе теряют возможность применять НД?
Нет, только одна. Лишить НД можно только ту, которая его использует. У второй НД нет, пока жива первая, поэтому лишить того чего нет - нельзя.
Я тоже так думал, пока не решил перечитать правила ещё раз
Цитата относится к принципа действия, а не к особенности роли кузнеца. Он лишает возможности убивать. Возможности заражать не лишает.