Вообще при обновлении (по сети) настройки не должны обнуляться.
В коде четко прописано копирование значений настроек из устаревшей версии ini в новый. У меня все работает. И подобные жалобы крайне редки.
Возможно дело в том что в таком случае лончер нужно запускать от админа или установить самый широкий доступ к файлам в папке игры.
***
Описане всех твиков в лончере***