Если я понял правильно. то имеется ввиду что полигоны с сглаживаниям, то есть с заукруглинными рёбрами. В игре такого быть не может. Думаю стоит попробовать в текстурировании решить проблему.
Могу предположить, ТОЛЬКО ПРЕДПОЛОЖИТЬ. Текстурирования делалось в блендаре с заукругленными полигонами. При экспорте заукругления пропали, текстуру чуток поростягивало местами, то там, то там вот и видна разница, это только мои предположения.
Текстурирования правильнее будет сделать на модели та что слева, или не использовать сглаживания.