Логистику можно взять, если выпадет, но брать в расчет заранее не стоит, 2%.
Образование, ИМХО обязательно, поскольку из гнома, как правило, делается маг, лишние статы не помешают, плюс, как я уже говорил, притяжение магии и разгадка тайного помогут.
Хаос или свет? Это зависит от личных предпочтений, врага, предположительной длительности игры и т. д.. Преимущества света уже описал Игрок. Хаос - тоже не плохо, лучше всего сочетать его с огненным шаром, пирокинезом, пользоваться знаком огня у жрецов, и если повезет с чародейством, то прокачать удачливого чародея, вот тогда хаос будет действительно убойным, даже если колдовство не очень большое.
Чародейство есть смысл качать только если идем в хаос. Да и редко он выпадает.
Защиту можно брать ради готовности, которая у гнома качается очень просто. Либо брать нападение, гному оно тоже важно, ибо параметр атаки не большой, сами существа дамажат не сильно. Из-за больших количеств войск неплохо смотрится боевое безумие.
Удача или лидерство. Тут на личное усмотрение, и то, и другое качать не так сложно; и там, и там есть полезные перки.