Программой можно изменять всё то, что уже есть в архиве карты, добавлять свои файлы, основываясь на данных того же map.xdb, например. С рельефом вряд ли получится что-либо сделать, уж больно файл непонятный.
Добавлено через 8 минут
Её надо будет доделать так, чтобы распаковывала только нужные файлы, а не все подряд.