temnyrizar, можно вот так сделать. Перед функцией впишем переменную с числом, когда функция запустится - она проиграет сцену, выдаст msgbox, квест, а после заполнит переменную числом, с которым эта часть кода функции больше не станет срабатывать т.к. условие не выполняется:

golemhouse_scene = 0

function golemhouse()
   if golemhouse_scene == 0 then
      StartDialogScene("/DialogScenes/DefiantMage/S1/DialogScene.xdb#xpointer(/DialogScene)");
      MessageBox(quest1);
      SetObjectiveState("sec1", OBJECTIVE_ACTIVE, p1);
      golemhouse_scene = 1
   end
   local gems = GetPlayerResource(p1, GEM)
   if gremlins >= 1000 and gems >= 100 then
      QuestionBox(pyramidpath, "yes", "no");
      end
end